Primo Ramdisk 原生支持 FAT/FAT32/NTFS 文件系统。这意味着虚拟硬盘可以自动被格式化成上述文件系统。同时，Primo Ramdisk 允许对文件系统的相关参数，比如簇大小、卷标、根目录文件夹等，进行自定义设置。和同类大部分产品不同，Primo Ramdisk 对文件系统的支持不需要借助于镜像文件实现，因此可以避免镜像文件影响开关机速度的问题，同时又可以保持虚拟硬盘文件系统的初始结构。当然，如果您为虚拟硬盘关联了镜像文件，则可以将虚拟硬盘格式化成 Windows 支持的任意文件系统，并且虚拟硬盘的文件系统和镜像文件内容保持一致。请参见篇章：镜像文件。
基本文件系统设置
在这个向导页面，您可以选择需要的文件系统，并设置簇大小、卷标以及其它设置。如果您在后续使用中将 Windows 环境变量 TEMP/TMP 设置到该虚拟硬盘，则需要勾选选项自动创建"TEMP"文件夹。
高级文件系统设置
在这个向导页面，您可以根据需要设置文件系统的高级属性。
(1) 自定义文件夹
您可以设置自定义文件夹，这些文件夹在虚拟硬盘创建时或每次计算机启动时会自动创建在根目录下。目前 Primo Ramdisk 允许创建最多10个自定义文件夹。
要启用自定义文件夹，首先请勾选选项自动创建自定义文件夹。然后在选项正下方的文本框中鼠标双击空白区域，可输入文件夹名称。如果需要删除自定义文件夹，则从列表中选中该文件夹名，然后点击 
按钮。
(2) 自定义卷序列号
默认状态下，Primo Ramdisk 会自动为虚拟硬盘生成一个卷序列号。如果有特别需要，您也可以自定义该序列号。首先勾选选项自定义卷序列号，然后输入8个十六进制数字作为卷序列号。
(3) 自定义 NTFS 账户"Everyone"的权限
当虚拟硬盘被格式成 NTFS 文件系统时，出于安全原因考虑，在默认情况下账户"Everyone"的访问权限是严格限制的。这在某些应用中可能产生问题，例如当您希望将虚拟硬盘共享给网络其它用户（特别是匿名用户）使用时，匿名用户由于没有权限将无法访问该虚拟硬盘。因此 Primo Ramdisk 允许您根据需要设置账户"Everyone"的各项访问权限，以解决上述可能出现的问题。